Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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