Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms