Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptcd3Q14C51 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ptcd3Q14C51 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ptcd3Q14C51 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ptcd3Q14C51 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ptcd3Q14C51 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ptcd3Q14C51 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ptcd3Q14C51 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms