Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms