Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms