Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms