Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms