Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MestQ07646 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms