Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms