Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms