Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms