Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms