Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl7Q03366 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms