Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms