Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax5Q02650 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms