Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GscQ02591 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GscQ02591 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms