Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RykQ01887 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RykQ01887 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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RykQ01887 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RykQ01887 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms