Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms