Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms