Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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