Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yy1Q00899 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms