Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms