Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gabpb1Q00420 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gabpb1Q00420 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gabpb1Q00420 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gabpb1Q00420 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gabpb1Q00420 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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