Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms