Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited1P97769 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms