Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms