Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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