Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tp53bp1P70399 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms