Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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