Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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