Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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