Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp46P62069 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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