Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vbp1P61759 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vbp1P61759 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vbp1P61759 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vbp1P61759 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vbp1P61759 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vbp1P61759 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vbp1P61759 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vbp1P61759 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vbp1P61759 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vbp1P61759 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vbp1P61759 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms