Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rnd3P61588 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms