Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PlnP61014 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PlnP61014 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PlnP61014 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PlnP61014 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PlnP61014 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PlnP61014 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PlnP61014 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PlnP61014 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PlnP61014 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms