Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms