Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm2P58774 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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