Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P58686 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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P58686 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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P58686 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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P58686 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P58686 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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