Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms