Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HccsP53702 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HccsP53702 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HccsP53702 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HccsP53702 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms