Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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