Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1swP51491 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms