Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MipP51180 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MipP51180 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
MipP51180 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MipP51180 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MipP51180 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms