Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtbrP50284 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtbrP50284 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbrP50284 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms