Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms