Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms