Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms