Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pde6aP27664 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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