Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U2af2P26369 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1220.4 ms