Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms